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Carine: /* 7. Desenho de símbolo para início de transcrição */

Carine — Mon, 28 Mar 2011 19:45:51 GMT

7. Desenho de símbolo para início de transcrição

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-	Este símbolo é feito de uma linha vertical e seta horizontal. Desenhe a linha e a seta usando o {{TutorialImage\|newline.gif}}''linha''e {{TutorialImage\|newarrow.gif}}o botão ''seta'' e coloque-os corretamente, arrastando as alças.	+	Este símbolo é feito de uma linha vertical e seta horizontal. Desenhe a linha e a seta usando o {{TutorialImage\|newline.gif}} ''linha'' e {{TutorialImage\|newarrow.gif}} o botão ''seta'' e coloque-os corretamente, arrastando as alças.
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	==== 8. Grupo de todas as linhas e etiquetas ====		==== 8. Grupo de todas as linhas e etiquetas ====
	Para torná-lo mais fácil de lidar com a ilustração E-box, você pode agrupá-la. Desta forma, os elementos serão selecionados em conjunto, para que você possa mover o grupo como um todo, ao invés de ter que mover cada elemento separadamente. Para criar o grupo, selecione todas as linhas e etiquetas que você criou nas etapas anteriores, clique com o botão direito sobre uma das linhas e selecione ''Grupo Grupo->'' no menu pop-up de imprensa, ou ''CTRL-G '" no teclado. Você pode desagrupar os elementos agrupados pelo botão direito do mouse e selecionar o grupo ''Grupo-> Desagrupar'', ''ou pressionando CTRL-G''novamente.		Para torná-lo mais fácil de lidar com a ilustração E-box, você pode agrupá-la. Desta forma, os elementos serão selecionados em conjunto, para que você possa mover o grupo como um todo, ao invés de ter que mover cada elemento separadamente. Para criar o grupo, selecione todas as linhas e etiquetas que você criou nas etapas anteriores, clique com o botão direito sobre uma das linhas e selecione ''Grupo Grupo->'' no menu pop-up de imprensa, ou ''CTRL-G '" no teclado. Você pode desagrupar os elementos agrupados pelo botão direito do mouse e selecionar o grupo ''Grupo-> Desagrupar'', ''ou pressionando CTRL-G''novamente.
	{{Template:TutorialNavigate\|5}}		{{Template:TutorialNavigate\|5}}

Carine: Ilustração do realçador E- box

Carine — Mon, 28 Mar 2011 19:44:05 GMT

Ilustração do realçador E- box

Carine: Ilustração do realçador E- box

Carine — Mon, 28 Mar 2011 19:33:08 GMT

Ilustração do realçador E- box

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{{Template:TutorialNavigate|5}}
== Ilustração do realçador E- box ==
{{TutorialVideo|R3_gF30lVXk|360|Drawing the E-box element}}
Genes-alvo da via relógio circadiano conter o E-box''elementos enhancer cis''-regulação. O heterodímero Bmal1/Clock ativa diretamente a expressão destes genes pela ligação com a seqüência caixa de e-mail. Nesta seção, vamos desenhar uma ilustração desse processo. Vai tornar-se um elemento puramente visual da via, por isso não é anotado para qualquer banco de dados biológicos e será adicionado para efeito ilustrativo apenas.

{{ TutorialHint | Nesta WikiPathways tutorial e depois, você vai ver muitos elementos em uma via que tem um significado biológico claramente definido e pode ser anotado para um banco de dados externo. Exemplos são seqüências genômicas, SNPs, locais de celular, tipos de interação. Estamos trabalhando no apoio a estes tipos de anotações em versões futuras.}}
O vídeo da direita mostra como desenhar o elemento de caixa eletrônico, que no final será parecido com este:
{|class=prettytable
|{{TutorialImage|e-box.png}}
|}
Abaixo está uma descrição passo-a-passo de como criar um elemento:
==== 1. Desenho de uma linha horizontal ====
Comece com uma linha horizontal, clicando no menu botão "linha" {{TutorialImage | newlinemenu.gif}} suspenso e selecione o botão ''linha''. Depois, vá até o local do desenho onde você deseja que a linha comece. Pressione o botão do mouse pressionado, arraste o mouse para a direita (mantendo o botão pressionado!) e solte o botão no local onde você deseja que a linha fique. Você pode modificar a localização dos pontos de início e término, arrastando as alças (quadrados amarelos). Você pode modificar a localização de toda a linha, clicando na linha em si e arrastando-o.
{{TutorialHint | Você pode facilmente fazer uma linha perfeitamente horizontal ou vertical, segurando a tecla Shift em seu teclado enquanto estiver movendo um fim de linha. Isso irá tirar os ângulos de linhas fixas.}}

==== 2. Copiar / colar a linha ====
Queremos agora uma segunda linha horizontal de mesmo comprimento e paralela à primeira linha. Portanto, vamos copiar a linha a partir da etapa anterior. Selecione a linha, clicando sobre ela, a linha ficará vermelha e as duas alças serão visíveis. Agora clique no {{TutorialImage | copy.gif}} botão ''cópia''. A linha é copiada para o clipboard do sistema. Você pode colar uma cópia da linha, pressionando a {{TutorialImage | paste.gif}} botão ''colar''. Uma cópia da linha agora aparece um pouco abaixo da linha original.
==== 3. Alinhamento de duas linhas na vertical ====
Para colocar as linhas exatamente abaixo do outro, selecione ambas as linhas e pressione a tecla {{TutorialImage | aligncenterx.gif}} botão ''alinhar centro horizontal''. Você pode selecionar vários objetos pressionando o mouse em uma parte vazia do desenho, para isto, mantenha o botão do mouse pressionado e arraste o mouse para incluir ou excluir elementos da seleção. Você também pode marcar ou desmarcar vários objetos clicando neles enquanto mantém a tecla ''Shift''no seu teclado.
==== 4. Criação de Etiquetas ====
Agora temos duas linhas horizontais paralelas, que representam um pedaço de DNA. Podemos identificar a caixa de E-região, colocando uma etiqueta sobre as linhas. Para adicionar uma etiqueta use {{TutorialImage | newlabel.gif}} botão ''rótulo''.
==== 5. Definir o texto do rótulo de "caixa-E"e aplicar o esquema 'quadrado' ====
Propriedades das etiquetas podem ser editadas na tabela ''Propriedades''. Defina a propriedade ''texto da etiqueta'' em 'E-box "com um duplo clique na célula na ''coluna'' relacionada:{|class=prettytable
|{{TutorialImage|textlabel.png}}.
|}
Da mesma forma, você pode definir um contorno retangular, selecionando o ''Retângulo'' para o esquema ''Propriedade''. Finalmente, use as alças para redimensionar o rótulo para que este se encaixe exatamente entre as duas linhas horizontais.
==== 6. Copie / cole o texto do rótulo e mude para 'Gene' ====
O downstream do elemento de caixa eletrônico é o gene que será ativado. Podemos denotar esta com um rótulo também. Copie / cole o rótulo e altere o texto para "genes", uma vez que usamos um único elemento para representar múltiplos genes que são activados. Arraste o rótulo para colocá-lo na posição correta.
==== 7. Desenho de símbolo para início de transcrição ====
Para tornar claro que os genes downstream do elemento de caixa de E-box são transcritas após a ativação, o símbolo a seguir é usado:
{|class=prettytable
|{{TutorialImage|transcription.png}}
|}
Este símbolo é feito de uma linha vertical e seta horizontal. Desenhe a linha e a seta usando o {{TutorialImage | newline.gif}}''linha''e {{TutorialImage | newarrow.gif}}o botão ''seta'' e coloque-os corretamente, arrastando as alças.
==== 8. Grupo de todas as linhas e etiquetas ====
Para torná-lo mais fácil de lidar com a ilustração E-box, você pode agrupá-la. Desta forma, os elementos serão selecionados em conjunto, para que você possa mover o grupo como um todo, ao invés de ter que mover cada elemento separadamente. Para criar o grupo, selecione todas as linhas e etiquetas que você criou nas etapas anteriores, clique com o botão direito sobre uma das linhas e selecione ''Grupo Grupo->'' no menu pop-up de imprensa, ou ''CTRL-G '" no teclado. Você pode desagrupar os elementos agrupados pelo botão direito do mouse e selecionar o grupo ''Grupo-> Desagrupar'', ''ou pressionando CTRL-G''novamente.
{{Template:TutorialNavigate|5}}

←Older revision		Revision as of 19:44, 28 March 2011
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	Genes-alvo da via relógio circadiano conter o E-box''elementos enhancer cis''-regulação. O heterodímero Bmal1/Clock ativa diretamente a expressão destes genes pela ligação com a seqüência caixa de e-mail. Nesta seção, vamos desenhar uma ilustração desse processo. Vai tornar-se um elemento puramente visual da via, por isso não é anotado para qualquer banco de dados biológicos e será adicionado para efeito ilustrativo apenas.		Genes-alvo da via relógio circadiano conter o E-box''elementos enhancer cis''-regulação. O heterodímero Bmal1/Clock ativa diretamente a expressão destes genes pela ligação com a seqüência caixa de e-mail. Nesta seção, vamos desenhar uma ilustração desse processo. Vai tornar-se um elemento puramente visual da via, por isso não é anotado para qualquer banco de dados biológicos e será adicionado para efeito ilustrativo apenas.

-	{{ TutorialHint \| ~~Nesta WikiPathways~~ tutorial e depois, você vai ver muitos elementos em uma via que tem um significado biológico claramente definido e pode ser anotado para um banco de dados externo. Exemplos são seqüências genômicas, SNPs, locais de celular, tipos de interação. Estamos trabalhando no apoio a estes tipos de anotações em versões futuras.}}	+	{{ TutorialHint \| Neste tutorial WikiPathways e depois, você vai ver muitos elementos em uma via que tem um significado biológico claramente definido e pode ser anotado para um banco de dados externo. Exemplos são seqüências genômicas, SNPs, locais de celular, tipos de interação. Estamos trabalhando no apoio a estes tipos de anotações em versões futuras.}}
	O vídeo da direita mostra como desenhar o elemento de caixa eletrônico, que no final será parecido com este:		O vídeo da direita mostra como desenhar o elemento de caixa eletrônico, que no final será parecido com este:
	{\|class=prettytable		{\|class=prettytable
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	Abaixo está uma descrição passo-a-passo de como criar um elemento:		Abaixo está uma descrição passo-a-passo de como criar um elemento:
	==== 1. Desenho de uma linha horizontal ====		==== 1. Desenho de uma linha horizontal ====
-	Comece com uma linha horizontal, clicando no menu botão "linha" {{TutorialImage \| newlinemenu.gif}} suspenso e selecione o botão ''linha''. Depois, vá até o local do desenho onde você deseja que a linha comece. Pressione o botão do mouse pressionado, arraste o mouse para a direita (mantendo o botão pressionado!) e solte o botão no local onde você deseja que a linha fique. Você pode modificar a localização dos pontos de início e término, arrastando as alças (quadrados amarelos). Você pode modificar a localização de toda a linha, clicando na linha em si e arrastando-o.	+	Comece com uma linha horizontal, clicando no menu botão "linha" {{TutorialImage\|newlinemenu.gif}} suspenso e selecione o botão ''linha''. Depois, vá até o local do desenho onde você deseja que a linha comece. Pressione o botão do mouse pressionado, arraste o mouse para a direita (mantendo o botão pressionado!) e solte o botão no local onde você deseja que a linha fique. Você pode modificar a localização dos pontos de início e término, arrastando as alças (quadrados amarelos). Você pode modificar a localização de toda a linha, clicando na linha em si e arrastando-o.
	{{TutorialHint \| Você pode facilmente fazer uma linha perfeitamente horizontal ou vertical, segurando a tecla Shift em seu teclado enquanto estiver movendo um fim de linha. Isso irá tirar os ângulos de linhas fixas.}}		{{TutorialHint \| Você pode facilmente fazer uma linha perfeitamente horizontal ou vertical, segurando a tecla Shift em seu teclado enquanto estiver movendo um fim de linha. Isso irá tirar os ângulos de linhas fixas.}}

	==== 2. Copiar / colar a linha ====		==== 2. Copiar / colar a linha ====
-	Queremos agora uma segunda linha horizontal de mesmo comprimento e paralela à primeira linha. Portanto, vamos copiar a linha a partir da etapa anterior. Selecione a linha, clicando sobre ela, a linha ficará vermelha e as duas alças serão visíveis. Agora clique no {{TutorialImage \| copy.gif}} botão ''cópia''. A linha é copiada para o clipboard do sistema. Você pode colar uma cópia da linha, pressionando a {{TutorialImage \| paste.gif}} botão ''colar''. Uma cópia da linha agora aparece um pouco abaixo da linha original.	+	Queremos agora uma segunda linha horizontal de mesmo comprimento e paralela à primeira linha. Portanto, vamos copiar a linha a partir da etapa anterior. Selecione a linha, clicando sobre ela, a linha ficará vermelha e as duas alças serão visíveis. Agora clique no {{TutorialImage\|copy.gif}} botão ''cópia''. A linha é copiada para o clipboard do sistema. Você pode colar uma cópia da linha, pressionando a {{TutorialImage\|paste.gif}} botão ''colar''. Uma cópia da linha agora aparece um pouco abaixo da linha original.
	==== 3. Alinhamento de duas linhas na vertical ====		==== 3. Alinhamento de duas linhas na vertical ====
-	Para colocar as linhas exatamente abaixo do outro, selecione ambas as linhas e pressione a tecla {{TutorialImage \| aligncenterx.gif}} botão ''alinhar centro horizontal''. Você pode selecionar vários objetos pressionando o mouse em uma parte vazia do desenho, para isto, mantenha o botão do mouse pressionado e arraste o mouse para incluir ou excluir elementos da seleção. Você também pode marcar ou desmarcar vários objetos clicando neles enquanto mantém a tecla ''Shift''no seu teclado.	+	Para colocar as linhas exatamente abaixo do outro, selecione ambas as linhas e pressione a tecla {{TutorialImage\|aligncenterx.gif}} botão ''alinhar centro horizontal''. Você pode selecionar vários objetos pressionando o mouse em uma parte vazia do desenho, para isto, mantenha o botão do mouse pressionado e arraste o mouse para incluir ou excluir elementos da seleção. Você também pode marcar ou desmarcar vários objetos clicando neles enquanto mantém a tecla ''Shift''no seu teclado.
	==== 4. Criação de Etiquetas ====		==== 4. Criação de Etiquetas ====
-	Agora temos duas linhas horizontais paralelas, que representam um pedaço de DNA. Podemos identificar a caixa de E-região, colocando uma etiqueta sobre as linhas. Para adicionar uma etiqueta use {{TutorialImage \| newlabel.gif}} botão ''rótulo''.	+	Agora temos duas linhas horizontais paralelas, que representam um pedaço de DNA. Podemos identificar a caixa de E-região, colocando uma etiqueta sobre as linhas. Para adicionar uma etiqueta use {{TutorialImage\|newlabel.gif}} botão ''rótulo''.
	==== 5. Definir o texto do rótulo de "caixa-E"e aplicar o esquema 'quadrado' ====		==== 5. Definir o texto do rótulo de "caixa-E"e aplicar o esquema 'quadrado' ====
-	Propriedades das etiquetas podem ser editadas na tabela ''Propriedades''. Defina a propriedade ''texto da etiqueta'' em 'E-box "com um duplo clique na célula na ''coluna'' relacionada:{\|class=prettytable	+	Propriedades das etiquetas podem ser editadas na tabela ''Propriedades''. Defina a propriedade ''texto da etiqueta'' em 'E-box "com um duplo clique na célula na ''coluna'' relacionada:
		+	{\|class=prettytable
	\|{{TutorialImage\|textlabel.png}}.		\|{{TutorialImage\|textlabel.png}}.
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	Da mesma forma, você pode definir um contorno retangular, selecionando o ''Retângulo'' para o esquema ''Propriedade''. Finalmente, use as alças para redimensionar o rótulo para que este se encaixe exatamente entre as duas linhas horizontais.		Da mesma forma, você pode definir um contorno retangular, selecionando o ''Retângulo'' para o esquema ''Propriedade''. Finalmente, use as alças para redimensionar o rótulo para que este se encaixe exatamente entre as duas linhas horizontais.
	==== 6. Copie / cole o texto do rótulo e mude para 'Gene' ====		==== 6. Copie / cole o texto do rótulo e mude para 'Gene' ====
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-	Este símbolo é feito de uma linha vertical e seta horizontal. Desenhe a linha e a seta usando o {{TutorialImage \| newline.gif}}''linha''e {{TutorialImage \| newarrow.gif}}o botão ''seta'' e coloque-os corretamente, arrastando as alças.	+	Este símbolo é feito de uma linha vertical e seta horizontal. Desenhe a linha e a seta usando o {{TutorialImage\|newline.gif}}''linha''e {{TutorialImage\|newarrow.gif}}o botão ''seta'' e coloque-os corretamente, arrastando as alças.
	==== 8. Grupo de todas as linhas e etiquetas ====		==== 8. Grupo de todas as linhas e etiquetas ====
	Para torná-lo mais fácil de lidar com a ilustração E-box, você pode agrupá-la. Desta forma, os elementos serão selecionados em conjunto, para que você possa mover o grupo como um todo, ao invés de ter que mover cada elemento separadamente. Para criar o grupo, selecione todas as linhas e etiquetas que você criou nas etapas anteriores, clique com o botão direito sobre uma das linhas e selecione ''Grupo Grupo->'' no menu pop-up de imprensa, ou ''CTRL-G '" no teclado. Você pode desagrupar os elementos agrupados pelo botão direito do mouse e selecionar o grupo ''Grupo-> Desagrupar'', ''ou pressionando CTRL-G''novamente.		Para torná-lo mais fácil de lidar com a ilustração E-box, você pode agrupá-la. Desta forma, os elementos serão selecionados em conjunto, para que você possa mover o grupo como um todo, ao invés de ter que mover cada elemento separadamente. Para criar o grupo, selecione todas as linhas e etiquetas que você criou nas etapas anteriores, clique com o botão direito sobre uma das linhas e selecione ''Grupo Grupo->'' no menu pop-up de imprensa, ou ''CTRL-G '" no teclado. Você pode desagrupar os elementos agrupados pelo botão direito do mouse e selecionar o grupo ''Grupo-> Desagrupar'', ''ou pressionando CTRL-G''novamente.
	{{Template:TutorialNavigate\|5}}		{{Template:TutorialNavigate\|5}}